Declarada en 1982 Monumento Historico Artistico Nacional.

Este modelo deriva en fachada y planta de la iglesia de «Il Gesú», de Roma, obra del italiano Vignola, iglesia que tuvo una inmensa repercusión en la arquitectura eclesiástica europea de los siglos XVII y XVIII.

La Congregación del Oratorio de San Felipe Neri construyó esta monumental iglesia entre los años 1725 y 1736, según planos atribuidos al padre Tosca. En 1837, al ser declarado en ruinas el templo parroquial de Santo Tomás Apóstol, se unió al de la Congregación la titulación de aquella parroquia, pues los padres habían abandonado la iglesia del oratorio por las leyes de exclaustración de 1835. De aqui toma su actual nombre de Iglesia de Santo Tomás y San Felipe Neri popularmente conocida como Iglesia de La Congregación.

La iglesia de Santo Tomás Apóstol se encontraba en la calle Avellanas pegada al Palacio Arzobispal. Como hemos comentado en 1837 la titulación de la parroquia pasó a San Felipe Neri y en 1862 la iglesia fué finalmente demolida.

La fachada formada por dos cuerpos de desigual anchura, estan separados por una enorma cornisa con un frontón curvo, y en la cima una gran frontón triangular con el escudo de la Congregación de San Felipe Neri.

Fruto del ingenio del fraile-arquitecto fué la fachada de la iglesia, de ladrillos encarnados, y es de aquellas que llaman "de orden compuesto" pues sus tres cuerpos aparecen, sucesivamente, pilastras de los órdenes dórico, jónico y corintio. Ademas hay toda una serie de motivos ornamentales, como un medallón en el que aparece San Felipe Neri, antiguo propietario del templo, en arrebatado éxtasis en el primer cuerpo, además de otros santos del Oratorio, que fundó San Felipe Neri.

En el segundo cuerpo llenan las hornacinas los Evangelistas San Marcos con el león y San Juan, en los extremos de este segundo cuerpo dos santos destacan en las esquinas de la cornisa. El atico ha quedado reservado para San Juan Bautista y San Juan Evangelista con el simbolo del aguila.

En la portada por encima del frontón curvo partido, dos imagenes femeninas que representan a la Virginidad adornada con las flores de la pureza y la Oración que sujeta el incensario del culto divino. Sobre el dintel campea un escudo nobiliario y por encima de este el ovalo antes citado en el cual San Felipe Neri en arrebatado extasis se arrodilla ante la Virgen y el Niño. A ambos lados de la puerta y en sendas hornacinas las imagenes de los santos titulares de la iglesia Santo Tomás y San Felipe Neri.

En resumen la fachada principal muestra una clásica distribución de imágenes y espacio según el barroco defendido por Vignola, con estatuas de artistas como Juan Bautista Borja, Jaime Molins y el altorrelieve atribuido a Ignacio Vergara.

La torre campanario de planta cuadrada (5,5 metros de lado) estaría concluida en 1732 y tiene 45 metros de altura. En la misma encontramos un reloj de sol.

Las campanas originales desaparecieron durante la Guerra Civil Española, las actuales aunque antiguas fueron colocadas al finalizar el conflicto y sus nombres son: Vicent Maria, Tiple (1655), La Tercera (1692), San Felipe Neri (1940) y Sant Tomàs (1940)

Mas información sobre las campanas en "Campaners de la Catedral de València"

El interior de una sola nave y tres tramos, planta de cruz latina, bóveda de cañón con lunetos, capillas laterales comunicadas entre ellas, crucero y presbiterio de cabecera plana. Las capillas laterales con cúpulas y linternas.

En el altar mayor encontramos un retablo en madera en su color natural, realizado despues de la Guerra Civil ya que el original fué destruido durante la contienda.

En el crucero del templo se yergue majestuosa una artística cúpula con tambor octogonal al exterior pero circular por el interior, rematada por cupulín y linterna.

Es una airosa cupula con tejas azules, y todo el conjunto exterior de la iglesia demuestra que el Padre Tosca era un gran profesional, tanto levantando templos como levantando teatros, pues también lo hizo, aunque el que aqui tuvimos, obra suya, ya se encargarón nuestros antepasados de hacerlo desaparecer.

En este templo se exponen numerosos lienzos de Espinosa, José Vergara, Vicente López, así como diversas tablas góticas atribuidas a Joan de Joanes, repartidas por las capillas y sacristía del mismo.